История почитания апостола и евангелиста Иоанна Богослова в Савво-Крыпецком монастыре восходит к первым годам появления обители. Во второй половине XV века инок Святой горы Афон Савва покинул Балканы и пришел в пределы Псковской земли. Пробыв некоторое время в Снетогорском Рождества Пресвятой Богородицы и Спасо-Елеазаровском монастырях, преподобный Савва с благословения преподобного Евфросина поселился в урочище Крыпцы. Предание гласит о том, что старец Савва принес с собой из Византии образ святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова, возлюбленного ученика Господа нашего Иисуса Христа, и Сербское Евангелие. До наших дней сохранилось Сербское Евангелие и сберегается в Псковском Древлехранилище. Икона апостола Иоанна, написанная на доске, пребывала в Крыпецкой обители до 1923 года. В последующие годы икона вместе с другими святынями монастыря исчезла и находится в неизвестном месте.
Престольный праздник. Мчч. Евстратия, Авксентия, Евгения, Мардария и Ореста (284-305). Мц. Лукии (304). Преподобного Германа Аляскинского. 26 декабря 2018 года.
История возникновения этого храма восходит к 1822 году, когда настоятель Крыпецкого монастыря игумен Серафим обратился с покорнейшим прошением к Высокопреосвященнейшему Евгению, архиепископу Псковскому, Лифляндскому и Курляндскому и кавалеру, об освящении двух нижних приделов Иоанно-Богословского собора: первого - преподобного Саввы Крыпецкого, второго - преподобных Антония и Феодосия Киево-Печерских чудотворцев или мучеников Евстратия, Авксентия, Евгения, Мардария и Ореста. 28 августа того же года владыка Евгений освятил упомянутые храмы. Подписанные им антиминсы благоговейно сберегались в монастырской ризнице до закрытия монастыря в 1923 году.
После 80-летнего перерыва трудами приснопамятного архимандрита Дамаскина (Сахнюка, +2007) в 2003 году возобновились богослужения в центральном приделе нижнего подклета Иоанно-